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COlor PREdiction of MOlecules
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Snakemake for 3' Sequencing RNA Profiling analysis. https://bio.tools/3SRP
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Pipeline for exome sequencing with snakemake (BWA->HaplotypeCaller->VEP+GnomAD)
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This pipeline aims to provide unsupervised data analysis from Singlecell RNAseq data. The alignment is done with Tophat2 followed by htseqcount. After filtering, DeSeq2 and Vst are applied. Finally, the unsupervised analysis is done with WGCNA.
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RNAseq pipeline for gene expression quantification.
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